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KEGGtranslator: visualizing and converting the KEGG PATHWAY database to various formats

机译:KEGGtranslator:可视化并将KEGG PATHWAY数据库转换为各种格式

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摘要

Summary: The KEGG PATHWAY database provides a widely used service for metabolic and nonmetabolic pathways. It contains manually drawn pathway maps with information about the genes, reactions and relations contained therein. To store these pathways, KEGG uses KGML, a proprietary XML-format. Parsers and translators are needed to process the pathway maps for usage in other applications and algorithms.
机译:简介:KEGG PATHWAY数据库为代谢和非代谢途径提供了广泛使用的服务。它包含手工绘制的路径图,其中包含有关基因,反应和关系的信息。为了存储这些途径,KEGG使用了专有的XML格式KGML。需要解析器和翻译器来处理路径图,以便在其他应用程序和算法中使用。

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